Die Faxaflói-Bucht beherbergt 23 Walarten in einer 950 Quadratkilometer großen Wassersäule, die vom Irmingerstrom gespeist wird, wo Kabeljau-Wanderungen Zwerg- und Buckelwale das ganze Jahr über bis auf fünf Seemeilen an den alten Hafen von Reykjavík heranführen.
Der plötzliche Tiefenabfall der Bucht auf 250 Meter schafft nährstoffreiche Auftriebszonen mit Krill und Lodden, was diese Gewässer zu einem der zuverlässigsten Walbeobachtungsgebiete des Nordatlantiks macht. Papageientaucher kehren jedes Jahr im April zurück, um auf den Inseln Lundey und Akurey zu nisten; ihre Höhlen an den Klippen sind von den Ausflugsbooten aus zu sehen, die während der Brutzeit die guanobedeckten Felsvorsprünge der Inseln umkreisen.
Die kommerzielle Walbeobachtung begann hier 1991 und veränderte Islands Beziehung zu Walen nach dem Moratorium der Internationalen Walfangkommission. Die heutige Flotte reicht von stabilisierten Holzbooten bis hin zu starren Schlauchbooten mit einer Geschwindigkeit von bis zu 35 Knoten, die alle vom Geirsgata-Pier im alten Hafen von Reykjavík ablegen. Meeresbiologen begleiten die meisten Kreuzfahrten und identifizieren einzelne Buckelwale anhand von Flukenmustern, die im North Atlantic Humpback Whale Catalogue katalogisiert sind. Zu den am häufigsten gesichteten Walen gehören Zwergwale, die alle drei bis fünf Minuten auftauchen, um zu fressen, sowie Buckelwale, die zwischen Juni und September bei gemeinschaftlichen Fressmanövern aus dem Wasser springen.
Die Papageientaucherkolonien in der Faxaflói-Bucht erreichen mit 30.000 Brutpaaren ihren Höhepunkt, deren Anwesenheit auf das Laichen der Lodden abgestimmt ist, das jedes Frühjahr die flachen Bänke überflutet. Papageientaucher tauchen bis zu 60 Meter tief und schlagen ihre Flügel unter Wasser 400-mal pro Minute, um Sandaale und junge Fische zu fangen. Die Basaltplateaus der Inseln bieten optimales Nistgelände, und die Bootsbetreiber halten 50-Meter-Sperrzonen ein, um Störungen während der Brutzeit zu vermeiden. Weißschnauzendelfine erscheinen bei 40 Prozent der Sommerfahrten und reiten oft in Gruppen von acht bis fünfzehn Tieren in der Bugwelle mit.
Der Reykjavík-Walbeobachtungs- und Papageientaucher-Ausflug startet in einem Hafenviertel, das 1917 auf zurückgewonnenem Land erbaut wurde, wo das Schifffahrtsmuseum und das Restaurant FiskSúpa den Standort der alten Walfangstation markieren. Die Abfahrtshäufigkeit ist zwischen Mai und August am höchsten, wenn das Tageslicht über 23:00 Uhr hinausreicht und die Seebedingungen kleinere RIB-Boote begünstigen. Winterfahrten konzentrieren sich auf Orcas und Grindwale, die Heringsschwärmen in die tieferen Gräben der Bucht folgen, und bieten ein deutlich anderes maritimes Wildtierprofil als die papageientaucherreichen Sommermonate.
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